三蕊沟繁缕，矮小软弱的一年生草本。
茎长2-10厘米，匍匐，圆柱状，分枝多，节间短，节上生根。
叶对生，近膜质，卵状长圆形、披针形至条状披针形，长3-10毫米，宽1.5-3毫米，先端钝，基部渐狭，全缘，侧脉细，2-3对，上面无毛，无柄或具0.5-3毫米的短柄；
托叶小，膜质，三角形或卵状披针形，长0.7-1毫米，先端急尖，早落。
花单生叶腋，无梗或近无梗，后者花梗在果期梗稍延长，长0.3-0.4毫米；
萼片2-3，卵形，长0.5 (-0.7）毫米，先端钝，基部合生；
花瓣3，白色或粉红色，阔卵形或椭圆形，稍长于萼片；
雄蕊3，短于花瓣；
子房上位，扁球形，3室；
花柱3，分离，短而直立。
蒴果扁球形，直径1-1.5毫米，3室，3瓣裂，具多数种子。
种子长圆形，长约0.5毫米，近直生或稍弯曲，具细密的六角形网纹。
