蒙古莸的聚伞花序腋生，无苞片和小苞片。花萼钟状，外面密生灰白色绒毛，深5裂。花冠蓝紫色，长约1厘米，外面被短毛，5裂，下唇中裂片较长大，边缘流苏状。雄蕊4枚，几等长。蒴果椭圆状球形，无毛，果瓣具翅。
蒙古莸的模式标本采自内蒙古。
蒙古莸在不同地区有不同的别名，如兰州植物通志中称其为蒙古莸，陕西称为白沙蒿，宁夏称为山狼毒，而在中国沙漠地区药用植物中称为兰花茶。
蒙古莸的花果期是8月至10月。