兰屿秋海棠，多年生无茎草本。
根状茎长圆柱状，长7-8厘米，直径约0.8毫米，节密，残存多数膜质褐色的鳞片。
叶均基生，具长柄；
叶片两侧极不相等，轮廓卵状圆形或近圆形，长8-10厘米，宽5.5-7.5厘米；
先端急尖，基部深心形，窄侧宽约2-3厘米，宽侧宽约4厘米，向下延伸约3厘米，边缘有疏而浅不规则钝锯齿，上面深绿色，下面色淡，被小圆形突起，掌状脉，下面明显呈深紫色，窄侧3条，宽侧5条，近中部呈羽状；
叶柄长7.5-9厘米，粗而扁，两侧边呈膜质，无毛；
托叶卵形，长7-9毫米，无毛。
花葶高26-32厘米，细弱，有纵棱，无毛；
花白色至粉红色，有花8-10朵，呈二歧聚伞花序，首次分枝长2-3厘米，二次分枝长1.6-2厘米，均无毛；
苞片早落；
雄花：花梗长8-10毫米，无毛，花被片4，外轮2枚大，扁圆形，长约10毫米，宽约13毫米，先端圆，内轮2枚小，倒圆形或椭圆形，长约8毫米，宽约6毫米，先端圆钝；
雄蕊多数，整个呈球状，花丝长0.8-1毫米，花药长圆形，顶端钝；
雌花：花梗长1.5-2厘米，花被片5，子房卵状长圆形，无毛，3室，每室胎座具2裂片，花柱3，2裂，柱头螺旋状扭曲并带刺状乳头。
蒴果下垂，果梗长约2毫米，无毛，轮廓卵球形至圆卵形，长约1厘米，直径约8毫米，具有不等3翅，一个较大，半圆形，长8-9毫米，边呈圆形，另2个较小，呈窄新月形，长5-6毫米；
种子极多数，小，长圆形，淡褐色。
花期5月至8月。
