甘肃黄芪的模式标本采自甘肃马衔山。
甘肃黄芪的托叶离生，三角状披针形，长6-7毫米，具白色长缘毛。
甘肃黄芪的花萼管状，长7-9毫米，密被黑色柔毛，萼齿披针形或钻形，长2-3毫米。
甘肃黄芪的花冠是青紫色。