甘肃黄芪的花萼管状，长7-9毫米，密被黑色柔毛，萼齿披针形或钻形，长2-3毫米。
甘肃黄芪的龙骨瓣较旗瓣短或近等长，瓣片半卵形，具短耳，瓣柄与瓣片近等长。
甘肃黄芪的旗瓣倒卵形，长14-15毫米，先端微凹，基部渐狭成瓣柄。
甘肃黄芪的叶子是羽状复叶基生，有15-33片小叶，长4-11厘米。