甘肃黄芪的荚果狭椭圆状长圆形，先端尖，长13-14毫米，宽4-6毫米，稍膨胀，果颈与萼筒近等长。
甘肃黄芪的小叶卵形，长5-9毫米，宽2-4毫米，先端钝圆，基部圆形或微心形，近无柄。
甘肃黄芪的根直伸，暗褐色，颈部具数个细瘦的根状茎。
甘肃黄芪的种子是褐色，卵形。