祁连山黄芪的羽状复叶有9-13片小叶，叶柄长2-3厘米，托叶离生，叶状，椭圆形，长5-13毫米，宽3-7毫米，具白色缘毛。
祁连山黄芪的花冠黄色，干时呈黑褐色。
祁连山黄芪的茎多少短缩，具条棱，被极稀疏的白色或黑色柔毛。
7月