高原南星，块茎扁球形，直径2-4厘米。
鳞叶2-3，线状披针形，内面的长16-20厘米，下部绿色，上部紫色。
叶1-2，叶柄长15-50厘米，下部粗1-1.5厘米，绿色。
叶片3全裂，裂片无柄或具短柄，中裂片卵形、菱形或椭圆形，通常长胜于宽，锐尖或渐尖，基部楔形，长（7-）9-12厘米，宽3-11厘米；
侧裂片斜卵形或菱形，外侧较内侧宽，与中裂片近等大，侧脉脉距1-1.5厘米，集合脉距边缘5-8毫米。
花序柄短于叶柄，长10-26厘米，较叶柄纤细，绿色。
佛焰苞暗紫色或绿色，具绿色或百色条纹，管部宽圆柱形，长（3-）4-8厘米，直径1.5-2.5厘米，内面光滑，喉部边缘斜截形；
檐部卵状披针形，深紫色、黄绿色或绿色，长7-16厘米，宽2-6.5厘米，长渐狭至具2-5厘米长的尾尖。
肉穗花序单性，雄花序长2厘米，花疏；
雌花序长1.5厘米，花密；
附属器长鞭状，长15-45厘米，下部增粗成纺锤形或圆锥形，粗可达1厘米，基部渐狭为柄，非截形，伸出佛焰苞后明显渐狭，暗紫色，之字形弯曲，上部线形下垂。
雄花通常花药4，黄色，裂缝马蹄形。
雌花：子房倒卵圆形，花柱短，柱头小。
花期5月（西藏），8-9月（云南）。