小花耧斗菜，根圆柱形，灰褐色。
茎高15-45厘米，不分枝或在上部少分枝，无毛，通常无叶。
基生叶少数，为二回三出复叶；
叶片轮廓三角形，宽5-12厘米，中央小叶无柄或具1-3毫米的短柄，倒卵形至倒卵状楔形，长1.6-3.5厘米，宽1.1-2.2厘米，近革质，顶端三浅裂，浅裂片圆形，全缘或有时具2-3粗圆齿，侧面小叶通常无柄，二浅裂，与中央小叶近等长或稍短，表面绿色，无毛，背面淡绿色，疏被短柔毛或无毛，边缘稍内卷；
叶柄长4-14厘米，无毛。
花3-6朵，近直立；
苞片线状深裂；
花梗长2-4厘米；
萼片开展，蓝紫色，罕为白色，卵形，长1.5-2厘米，宽0.9-1.2厘米，顶端钝；
花瓣瓣片钝圆形，长3-5毫米，具短距，距长3-5毫米，末端直或微弯；
雄蕊比萼片短，花药黄色；
退化雄蕊狭椭圆形，白膜质，长5-6毫米，边缘皱曲；
心皮5，被腺状柔毛。
蓇葖长1.2-2.3厘米，直立，被长柔毛，顶端有一细长的喙；
种子黑色，长约2毫米。
六月开花。
