甘南岩蕨，植株高12-17厘米。
根状茎斜出，与叶柄基部密被鳞片；
鳞片披针形，长约3毫米，先端渐尖并为纤维状，膜质，全缘，幼时全为棕色，略有光泽，老时中部变为深棕色至深褐色，无光泽。
叶密集簇生；
柄长6-9厘米，粗达1毫米，暗禾秆色，基部以上与叶轴疏被长节状毛及少数棕色的线形小鳞片，质脆，往往于叶柄上部折断而中下部宿存成丛状；
叶片狭披针形，两端渐狭，偶数一回羽状；
羽片10-11对，对生，平展，疏离，无柄，下部1-2对羽片略缩短，通常为卵形，长仅4毫米，中部羽片较大，长椭圆形，有时为长卵形，长5-8毫米，基部宽3-5毫米，圆头，基部截形并紧靠叶轴，边缘为不整齐的波状，稍为内卷。
叶脉不明显，在羽片上为羽状，小脉分叉，几达叶边。
叶草质，干后棕色或棕褐色，两面疏被短毛，以下面较密。
孢子囊群圆形，着生于小脉的分叉处或分枝小脉的中部，位于叶缘与主脉之间，每羽片有3-5对；
囊群盖为许多卷发状、有间隔的长毛组成。