天山瘤果芹，植株高10厘米左右。
根纺锤形，长约5厘米，直径6-10毫米，棕褐色。
茎短缩，基部有叶鞘的残留纤维束。
基生叶有柄，长2-3厘米；
叶片长方状披针形，长2-5厘米，宽约1-1.5厘米，二回羽状分裂，一回羽片3-5对，无柄，末回羽片披针形，长2-3毫米，宽约1毫米；
茎生叶与基生叶同形，上部的茎生叶较小。
复伞形花序有3-5个总苞片，披针形或线形，膜质，全缘或2-3裂；
伞辐5-13，长短不一，长1-13厘米，向地面铺散；
小总苞片5-10，全缘或2-3裂至1回羽状分裂，裂片披针形或线形，与小伞形花序近等长；
小伞形花序有花15朵左右，萼齿不明显；
花瓣倒卵形，白色，基部有短爪。
果实宽卵形，果棱凸起，棱上及棱间都有小瘤；
花柱较花柱基长，斜向上升；
每棱槽中有油管2-3条；
胚乳腹面微凹或近平直。
花果期6-8月。