柔弱黄芩，一年生草本；
根茎匍匐，生须根。
茎高达20厘米，上升直立，柔弱，四棱形，密被白色具节平展疏柔毛，分枝，节间伸长，比叶长很多。
叶膜质，狭三角状卵圆形至长圆形，长1.3-3厘米，宽0.8-2.2厘米，先端锐尖，基部浅心形，边缘具波状圆齿，两面疏被具节疏柔毛，侧脉约4对，与中脉在两面稍明显；
叶柄长0.2-2.5厘米，下部者最长，上部者较短，扁平，密被白色具节平展疏柔毛。
花对生，于茎或分枝顶端排列成长3.5-8厘米的总状花序；
花梗长约2毫米，与序轴密被具腺平展微柔毛；
苞片椭圆形，最下一对较大，其余细小，长1.5-5毫米，膜质，全缘，无柄，两面被小疏柔毛。
花萼开花时长2毫米，被具腺微柔毛，果时长3毫米，盾片开花时高0.75毫米，果时高2毫米。
花冠紫色，长8毫米，外被短柔毛，内无毛；
冠筒长约6.5毫米，前方近基部囊状膨大不作膝曲状，近直伸，中部宽1.5毫米，至喉部宽达3毫米；
冠檐2唇形，上唇直伸，细小，先端微缺，下唇中裂片三角状卵圆形，比上唇长，宽3毫米，先端微缺，基部收缩，两侧裂片卵圆形，宽1.5毫米。
雄蕊4，二强；
花丝扁平，中部以下被小纤毛。
花盘肥厚，前方稍隆起；
子房柄极短。
花柱细长。
子房光滑，无毛。
成熟小坚果未见。
