狭叶黄芩，多年生草本；
根茎直伸或斜行，纤细，在节上生须根及匍枝。
茎直立，高26-30厘米，四棱形，具沟，基部粗1.2-1.5毫米，被有上曲短小柔毛，通常在棱上较密集，一般不分枝，偶有自基部生出长而靠贴的分枝，通常具不多分枝，中部节间长2.5-4厘米。
叶具极短的柄，柄粗壮，长0.5-1毫米，腹凹背凸，密被很短的小柔毛；
叶片披针形或三角状披针形，长1.7-3.3厘米，宽3-6毫米，先端钝，基部不明显浅心形或近截形，边缘全缘但稍内卷，上面密被微糙毛，下面密被微柔毛，脉上尤著，有分散的细粒状腺体，侧脉约3对，与中脉在上面凹陷下面凸起。
花单生于茎中部以上的叶腋内，偏向一侧；
花梗长约4毫米，密被微柔毛，基部有一对长1.5毫米、被疏柔毛的针状小苞片。
花萼开花时长4毫米，外面密被短柔毛，盾片很小，高约0.5毫米，果时花萼长6毫米，盾片高1毫米。
花冠紫色，长2-2.3（2.5）厘米，外面被短柔毛，内面在冠筒囊大部分上方及上唇与2侧裂片接合处疏被疏柔毛；
冠筒基部宽1.5毫米，至喉部宽达8毫米；
冠檐2唇形，上唇盔状，先端微缺，下唇中裂片大，近扁圆形，宽9毫米，全缘，2侧裂片长圆形，宽3.5毫米。
雄蕊4，均内藏，前对较长，具能育半药，退化半药不明显，后对较短，具全药，药室裂口具髯毛；
花丝扁平，前对内侧后对两侧中部被疏柔毛。
花柱细长，扁平，先端锐尖，微裂。
花盘环状，前方微膨大，后方延伸成长0.5毫米的子房柄，子房与花盘间有白色泡状体。
子房4裂，裂片等大。
小坚果黄褐色，卵球形，长1.25毫米，宽1毫米，具瘤状突起，腹面基部具果脐。
花期6-7月，果期7-9月。
