少脉黄芩，多年生草本。
茎高34厘米，直立，下部无叶且在节上具纤维状须根，分枝，枝条钝四棱形，具纵向细条纹，被极细的短柔毛。
叶近革质，卵圆形，长2-3.8厘米，宽1-2.2厘米，先端锐尖，基部楔形，边缘疏生3-4对圆齿，上面绿色，下面紫红色，两面初时密被极细短柔毛其后则近无毛，侧脉2对，最下一对基出，两面稍突出；
叶柄长3.5-6毫米，腹面具沟，背面圆凸，被极细的短柔毛。
花对生，排列成长4-6.5厘米顶生的总状花序；
花梗长3-4毫米，与序轴均密被极细的短柔毛；
苞片披针形，长6.5-8毫米，宽2.5-3.5毫米，无柄，全缘，两面被极细短柔毛或近无毛。
花萼长达5毫米，外面密被极细短柔毛，盾片开张，半圆形，高2毫米。
花冠白色带紫，长达1.6厘米，外面密被微柔毛；
冠筒长1.3厘米，近直伸，基部前方稍膨大；
冠檐2唇形，上唇盔状，先端波状，下唇3裂，中裂片卵圆形，基部宽3.5毫米，先端微凹，两侧裂片卵圆形，宽2毫米。
雄蕊4，二强；
花丝扁平，中部以下略具纤毛。
花盘肥厚、环状；
子房柄长0.5毫米。
花柱细长。
子房光滑。
小坚果未详。
花期4月。