阿里山鼠尾草，一年生草本；
须根密集，纤细。
茎高20-45厘米，钝四稜形，具槽，被倒伏的微柔毛。
叶大都基出或近基出，二回羽状复叶，顶生小叶较大，长0.8-2.5厘米，宽0.7-2厘米，先端锐尖或钝，基部斜截形或浅心形，边缘具不整齐的小裂片或粗圆齿，近膜质，上面散布微硬伏毛，下面沿脉上被极短的柔毛余部无毛，侧生小叶近圆形，但十分小，近无柄；
叶柄长1-2.5厘米，与叶轴背腹扁平，被倒伏的微柔毛。
轮伞花序2-5花，下部疏离，上部密集，组成长约达14厘米的顶生总状或总状圆锥花序；
苞片小，披针形，一般比花梗短，先端锐尖，基部楔形，全缘，无毛；
花梗长2-3毫米，密被短柔毛；
花序轴密被具腺疏柔毛及短柔毛。
花萼筒形，长约5毫米；
花后稍增大，长达6-6.5毫米，外面仅脉上被微柔毛或近无毛，内面在上部被极短微硬伏毛或近无毛，下部无毛，萼筒长约3.5毫米，萼檐二唇形，上唇近宽三角形，具3脉，两侧脉具狭翅，先端具短的小尖头，下唇半裂成2齿，齿长三角形，先端渐尖。
花冠长约6.5毫米，稍外伸，外面略被短柔毛，内面在冠筒中部具小疏柔毛毛环，冠筒长4.5毫米，基部筒状，宽约1毫米，在毛环处稍缢缩，自此向上渐宽大，至喉部宽达1.5毫米，冠檐二唇形，上唇直伸，长1毫米，先端具2圆裂片，下唇伸长，长2.5毫米，宽3.5毫米，3裂，中裂片最大，顶端2浅裂，裂片卵圆形，全缘，侧裂片卵圆形。
能育雄蕊2，近外伸，花丝长约1.5毫米，药隔长约3毫米，纤细，下臂较短，约为上臂的1/2，分离。
花柱内藏，先端近相等2浅裂，裂片线形，弯曲。
花盘近等大。
小坚果长圆形，长约1.5毫米，宽约0.5毫米，浅褐色。
花、果期4-5月。
