黄花鼠尾草，多年生草本3根茎粗短，其上覆有褐色鳞片及残存叶鞘，向下直伸粗大扭曲状条状根。
茎直立，高20-50厘米，钝四棱形，具四浅槽，被疏柔毛或变无毛，通常不分枝。
叶片卵圆形或三角状卵圆形，长2-7厘米，宽3.5-5厘米，先端锐尖或近钝形，基部戟形或稀心形，边缘具圆齿或重圆齿，纸质，上面密被或疏被平伏的疏柔毛，下面沿脉被短柔毛，余部密布紫褐色腺点；
叶柄长可达14厘米，短的近于无柄，毛被与茎相同。
轮伞花序通常4花，4-8个稍疏离组成顶生总状花序，或总状花序基部少分枝而组成总状圆锥花序；
苞片卵圆形，比花萼长或短，先端渐尖，基部近圆形，两面均被短柔毛，下面密布紫褐色腺点；
花梗长约3毫米，与花序轴密被长柔毛及具腺柔毛。
花萼钟形，开花时长约1厘米，外被具腺或无腺的疏柔毛，散布明显紫褐色腺点，内面满布微硬伏毛，二唇形，裂至花萼长1/3，上唇三角状卵圆形，长约3毫米，宽6毫米，先端有3个极短的小尖头，下唇比上唇稍长，长约5毫米，宽6毫米，半裂成2齿，齿三角形，先端锐尖。
花冠黄色，长2.3-3厘米，外面近无毛，内面近冠筒基部2-2.5毫米有斜向不完全的疏柔毛毛环，冠筒下部圆筒状，向上弯，在喉部增大，冠檐二唇形，上唇多少盔状，长7-10毫米，先端微凹，下唇3裂，中裂片最大，近倒卵圆形或近扇形，宽约8毫米，侧裂片略作半圆形。
能育雄蕊2，伸至上唇，花丝长约7毫米，药隔长约9毫米，中部着生处被小疏柔毛，上臂长约5毫米，下臂长约4毫米，横生药室，药室顶端联合。
退化雄蕊短小，长约1.5毫米。
花柱稍伸出，先端不相等2浅裂，后裂片不明显。
花盘前方稍膨大。
成熟小坚果未见。
花期7月。
