云南棱子芹，多年生草本。
高可达1米。
根粗壮，颈部被褐色带状残叶。
茎直立，中空，有条纹，基部粗可达15毫米。
基生叶有长柄，基部扩展呈鞘状，叶片轮廓宽三角形，长10-20厘米，2-3回羽状分裂，末回裂片狭卵形或长圆形，长1.5-2厘米，宽0.5-1厘米，边缘有锐锯齿；
茎上部的叶简化，有短柄或近于无柄。
顶生复伞形花序直径7-10厘米；
总苞片6-8，长圆形至宽披针形，长2-4厘米，宽1-2厘米，基部宽楔形，顶端条裂或叶状分裂，有宽的膜质边缘；
伞辐15-25，长3-5厘米，沿条棱有淡褐色粗糙毛；
小总苞片6-10，狭倒卵形，长10-15毫米，基部楔形，顶端3-5深裂，除中肋外其余均膜质；
小伞花序有花多数，花柄在结果时长达6-8毫米；
萼齿披针形，长约0.5毫米；
花瓣绿白色，倒卵形，长约1毫米，顶端内凹，有小舌片，基部有爪；
花药紫黑色。
果实卵形，长3-4毫米，表面密生微小的水泡状突起，果棱有狭翅，每棱槽中有油管2、合生面4。
花期8月，果期9月。
