波棱滇芎，多年生草本，高12-43厘米。
茎直立，中空，略带暗紫色，基部覆盖纤维状叶鞘。
较上部的茎生叶包括叶柄长8-10厘米；
叶片羽状分裂，羽片卵形，长约1.5厘米，边缘深裂至羽状半裂，末回裂片长2-4毫米，宽1-2毫米。
复伞形花序顶生，花序梗长9-18厘米；
总苞片4-6，上部羽状分裂，最后的裂片如同茎生叶的末回裂片；
伞辐14-17，不等长，长2.5-8.5厘米，有沟纹，略带紫色，小总苞片3-4，长于果柄，顶端多数3裂；
小伞形花序有花7-12；
萼齿细小。
果实卵形至广卵形，长约3.2毫米，基部微心形，顶端渐窄，主棱明显地凸起，稍呈波状褶皱；
花柱基隆起，花柱短；
胚乳腹面微凹。
花果期8-9月。
