木荚红豆的花序为圆锥花序，顶生，长8-14厘米，被短柔毛；花大，长2-2.5厘米，有芳香；花冠白色或粉红色，各瓣近等长；子房密被褐黄色短绢毛，内有胚珠7-9粒。
木荚红豆的木材纹理直，结构细匀，弦断面上无薄壁组织所形成的花纹。
木荚红豆的种子为横椭圆形或近圆形，微扁，长0.8-1.3厘米，宽6-8毫米，厚4-5毫米，种皮红色，光亮，种脐小，长约1.5-2.5毫米，位于短轴稍偏。
木荚红豆的叶子是奇数羽状复叶，长8-24.5厘米；叶柄长3-5厘米，叶轴长3.2-5.4厘米。小叶2-3对，厚革质，长椭圆形或长椭圆状倒披针形，长3-14厘米，宽1.3-5.3厘米，先端钝圆或急尖，基部楔形或宽楔形。