剑川马铃苣苔，多年生草本。
根状茎短而粗，长1厘米，直径6毫米。
叶全部基生，具叶柄；
叶片长圆形，长2-7厘米，宽1-2厘米，顶端微尖或钝，基部楔形，边缘具细牙齿，上面脉被黄褐色长柔毛，下面被较密的黄褐色长柔毛，侧脉每边4-5条，下面隆起；
叶柄长1.5-5厘米，与花序梗、苞片及花萼均被黄褐色长柔毛。
聚伞花序1-4条，每花序具1-3花；
花序梗长5-13厘米；
苞片线形，长2毫米；
花梗长0.8-1.7厘米。
花萼5裂至近基部，裂片长圆形，长4毫米，宽1.6毫米，顶端钝，全缘。
花冠细筒状，黄色，长1.6厘米，外面被短柔毛；
筒长约1厘米，直径约5毫米，喉部缢缩，近基部稍膨大；
檐部二唇形，上唇长约3毫米，裂片近圆形，长约2毫米，下唇长约7毫米，3裂，裂片倒卵形，长约5毫米，宽约3毫米，顶端圆形。
雄蕊分生，上雄蕊长4毫米，着生于距花冠基部2毫米处，下雄蕊长4毫米，着生于距花冠基部3毫米处，花丝近无毛，花药宽长圆形，长1.2毫米，药室顶端不汇合；
退化雄蕊长1毫米，着生于距花冠基部2毫米处。
花盘环状，高2毫米，5浅裂。
雌蕊无毛，长5毫米，子房卵形，长约4毫米，直径约2毫米，花柱短，长约1毫米。
蒴果披针形，长2-3厘米，直径6毫米，无毛。
花期6月。
