黑果薄柱草，小草本，无毛，干后变黑色；
茎匍匐，节上生根；
节间长1-3厘米；
小枝扁圆形。
叶阔卵形或卵状肾形，长4毫米，近基部宽8毫米，顶端钝尖，基部骤然收窄下延至叶柄；
叶柄纤细，比叶片长，边全缘；
托叶三角形，顶端长尖。
花无梗，顶生，单朵，长2.5毫米；
萼管卵形，萼檐全缘，环形；
花冠管形，上部4裂，裂片全缘，在放大镜下可见细小鸡冠状皱褶；
雄蕊4，花丝中部稍膨大，花药宽卵形，有极短的尖头；
花柱2，与花冠管等长，极向外弯，柱头鸡冠状。
核果近球形，成熟时黑色，直径4-4.5毫米，内有小核2颗；
小核革质，卵形，腹面平凹，背面平凸，中间具1槽。
花期2-3月。
