扭萼凤仙花，一年生草本，高40-50厘米，具少数支柱根，全株无毛。
茎直立，分枝，小枝细，开展，叶互生，具柄。
叶片近膜质，长圆形或卵状长圆形，长10-15 (20) 厘米，宽3-6厘米，顶端渐尖或尾状渐尖，边缘具圆齿状齿，齿端具小尖，齿间无刚毛，侧脉6-7对，弧状弯，在下面明显，上面暗绿色，下面浅绿色，叶柄长5-10毫米，无腺体。
总花梗生于上部叶腋或小枝端，近直立，短于叶，长6-7厘米，具6-8花，花总状排列。
花梗长1-1.5厘米，结果时伸长，开展，基部具苞片；
苞片钻形，长2-3毫米顶端急尖，宿存。
花黄色，长4厘米，侧生萼片2，膜质，肾状圆形，长约5毫米，宽3-4毫米，扭曲，顶端几达脐部；
旗瓣圆肾形，长1.5厘米，背面中肋增厚，具龙骨状突起，顶端喙尖；
翼瓣具宽柄，长2-2.5厘米，2裂，基部裂片小，圆形，上部裂片较长，斧形，顶端圆形，背部具反折的小耳，具紫色斑点；
唇瓣檐部囊状，长达2厘米，口部斜上，宽10-15毫米，先端尖，基部急狭成长15毫米，内弯顶端棍状粗的距。
花丝短而宽；
花药卵圆形，顶端尖。
子房纺锤形，直立，顶端尖，蒴果线形，长4-5厘米，顶端喙尖；
种子多数，长圆状倒卵形，长4毫米，栗褐色。
花期8-9月。
