粗梗糖芥，一年生草本，高15-30厘米；
茎直立，多从基部分枝，具2-3叉毛，上部分枝常伸展。
叶片椭圆状长圆形，窄倒披针形至线形，长4-5厘米，宽4-5毫米，顶端急尖，基部渐狭，边缘具波状牙齿至近全缘；
叶柄长1-1.5厘米，茎上部叶无柄。
总状花序顶生，少数下部花有1-2苞片；
萼片长圆形，长约4毫米，花瓣黄色，匙形，长约8毫米，顶端圆形，爪长约5.5毫米。
长角果近圆筒状或线状长圆形，长3-9厘米，宽1-1.5毫米，侧扁，开展，具贴生2-3叉毛，相当种子间处稍缢缩，果瓣具1中脉；
花柱极短或无，柱头头状，2裂；
果梗和长角果等粗，开展，长约3毫米；
种子长圆状椭圆形，长约1毫米，褐色。
花、果期5月。