三小叶翠雀花，茎直立，高50-90（-120）厘米，疏被反曲的短柔毛，下部变无毛，分枝。
基生叶及下部叶在开花时枯萎。
茎中部叶有长柄；
叶片五角形，长5.2-8.2厘米，宽7-12厘米，三全裂，全裂片有短柄，中央全裂片菱形，渐尖，中部三浅裂，边缘有少数牙齿，侧全裂片斜扇形，不等二深裂近基部，两面均疏被短伏毛；
叶柄与叶片近等长。
总状花序顶生，有3-8花；
下部苞片叶状，其他的椭圆形或长圆形；
花梗斜上展，长0.9-2厘米，与轴均密被反曲的短柔毛；
小苞片生花梗上部与花接近或与花邻接，倒披针状条形或条形，长3-7毫米，宽0.8-1.5毫米；
萼片紫色，椭圆形，长1-1.2厘米，外面被短柔毛，内面无毛，距钻形，长2.2-2.5厘米，直或稍向下弯；
花瓣紫色，无毛；
退化雄蕊紫色，瓣片约与爪等长，卵形，二裂稍超过中部，腹面疏被短柔毛，无黄色髯毛；
雄蕊无毛；
心皮3，无毛。
蓇葖长7-9毫米；
种子倒卵球状四面体形，长约2毫米，密生极狭的波状横翅。
7-8月开花。