天山翠雀花，茎高（40-）60-115厘米，被稍向下斜展的白色硬毛，等距地生叶。
基生叶在开花时通常枯萎，与茎下部叶有长柄；
叶片五角状肾形，长6-9厘米，宽9-14厘米，三深裂，中央深裂片菱状倒梯形或宽菱形，急尖，在中部之上三浅裂，有少数锐牙齿，侧深裂片斜扇形，不等二裂近中部，两面被稍密的糙伏毛；
叶柄长为叶片的1.5-5倍。
顶生总状花序有8-15花；
轴和花梗密被反曲的短糙伏毛；
基部苞片三裂，其他苞片披针状线形，长0.8-1.4厘米；
花梗长2-6厘米；
小苞片距花1.5-6毫米，线形或披针状线形，长5.5-9毫米，宽0.6-1毫米，背面有短糙伏毛；
萼片脱落，蓝紫色，卵形或倒卵形，长1.1-1.5厘米，外面密被短糙伏毛，距圆筒状钻形，长1.1-1.4厘米，基部粗约3毫米，花瓣黑色，微凹；
退化雄蕊黑色，瓣片近卵形，二裂，上部有长缘毛，腹面有黄色髯毛；
雄蕊无毛；
心皮3，子房密被短糙伏毛。
蓇葖长0.9-1.1厘米；
种子倒圆锥状四面体形，长1.5毫米，密生成层排列的鳞状横翅。
7-9月开花。
