甘肃翠雀花，茎高36-52厘米，有白色伸展的短柔毛，不分枝。
基生叶或近基生叶2-3，有长柄；
叶片肾形，极似毛翠雀花的叶，长3-3.4厘米，宽5.4-6厘米，三深裂稍超过中部，裂片互相稍分开，浅裂，边缘具短尖的圆牙齿，表面近无毛，背面疏被柔毛；
叶柄长约8厘米。
茎生叶1-2，小，具短柄。
总状花序狭长，长9-35厘米，疏生4-10花；
轴及花梗密被反曲的短柔毛；
下部苞片叶状，其他苞片不分裂，线状披针形；
花梗直展，长1-4.5厘米；
小苞片生花梗近顶端或与花邻接，披针形或狭披针形，长3.5-8.5毫米，宽1.2-1.8毫米；
萼片宿存，蓝紫色，外面被短柔毛，上萼片宽卵形，长约1.2厘米，距钻形，长约1.8厘米，基部粗约2.2毫米；
花瓣无毛，渐尖；
退化雄蕊瓣片长约5毫米，二裂至中部，腹面有白色髯毛，爪长约6毫米，基部有附属物；
花丝有疏毛；
心皮3，子房密被短柔毛。
蓇葖长1.3-1.8厘米；
种子褐色，三稜形，长1.2-2毫米，只沿稜有翅。
7-8月开花。