百山祖蹄盖蕨，能育叶长50-75厘米；
叶柄长30-38厘米，直径约1.5毫米，基部被浅褐色、狭披针形的鳞片，向上禾秆色，光滑；
叶片卵状披针形，长32-42厘米，宽16-20厘米，先端渐尖，基部略变狭，二回羽状；
羽片约12对，基部1 (-2) 对近对生，向上的互生，略斜展，有柄（长约3毫米），基部一对略缩短，长8-10厘米，宽2.4-3厘米，基部略变狭，第二对羽片披针形，长9-11厘米，基部宽2.6-3.6厘米，先端尾状渐尖，基部较宽，一回羽状；
小羽片9-12对，互生，有柄（长约1毫米），上先出，反折，卵状三角形，基部上侧1片较大，长1.3-2厘米，宽1-1.2厘米，急尖头，基部近对称，圆楔形，羽裂几达尖羽轴；
裂片4-6对，近长圆形，斜展，先端有2-3个钝齿牙。
叶脉两面可见，在裂片上为羽状，小脉2-3对，斜向上，单一。
叶干后草质，暗绿色，两面无毛；
叶轴和羽轴下面禾秆色，光滑，上面有极短的钝刺。
孢子囊群长圆形或弯钩形，成熟时往往满布小羽片下面；
囊群盖同形，褐色，膜质，近全缘或略有睫毛，宿存。
孢子周壁表面无褶皱。