黄花蒿含挥发油、青蒿素、青蒿内脂I、II、a-蒎烯、樟脑、按叶油素、青蒿酮等，还含黄酮类化合物和东茛菪内脂类化合物。
南方民间取黄花蒿的枝叶制酒饼或作制酱的香料。
黄花蒿有草蒿、青蒿、臭蒿、犱蒿、黄蒿、臭黄蒿、茼蒿、黄香蒿、野茼蒿、秋蒿、香苦草、野苦草、鸡虱草、黄色土因呈、假香菜、香丝草、酒饼草、苦蒿等别名。
青蒿素为抗疟的主要有效成分，治各种类型疟疾，具速效、低毒的优点，对恶性疟及脑疟尤佳。