凹裂毛麝香，细小草本，高5-10(-35)厘米，基部常多少弯曲或外倾，上部略具分枝。
茎圆柱状，被伸展的白色多细胞长柔毛。
叶在下部的早枯，中部的最大，卵形至卵圆形，长3-20毫米，基部宽楔形至亚心形，骤然收缩成柄，端圆钝至微尖，边缘自近基部1/3处起具不整齐的圆齿，上面有平伏的白色多细胞长柔毛，下面毛较疏或几无毛，密被黄色腺点，腺点脱落后留下褐色的凹窝。
总状花序顶生，被细而伸展的多细胞长柔毛；
苞片下部的为叶状，向上渐变小；
花梗长约1毫米；
小苞片狭条形，稍短于花萼；
萼5深裂几至基部；
萼齿稍不等，均为条状披针形，长约3毫米，被多细胞长柔毛；
花冠淡紫色，长约4.5毫米；
上唇卵状矩圆形，长约2毫米，多少弯陷，先端凹缺；
下唇稍短于上唇，裂片略成矩圆形，先端均深凹缺，尤以中裂为甚；
雄蕊二强，后方一对花药的两室中仅1室成熟，另1室小而中空，前方一对花药的两室中亦只1室成熟，但较后方那一对的为小。
蒴果卵圆形，长仅2毫米左右。
花果期8-11月。
