少花獐牙菜，多年生草本，高5-30厘米。
茎直立，下部黄绿色，上部带紫色，中空，近圆形，不分枝，基部被黑褐色枯老叶柄。
基生叶具柄。
叶片线状椭圆形或宽线形，长2.5-4.5厘米，宽0.6-0.8厘米，先端钝，基部渐狭成柄，叶脉1-3条，细而明显，叶柄细，扁平，长1-2.5厘米；
茎生叶1-2对，无柄，与基生叶相似而较小，长2.5-6厘米，宽0.3-0.7厘米，基部钝或圆形，离生，半抱茎。
单花顶生，稀2-3朵；
花梗直立，紫红色，长3.5-10.5厘米；
花5数，直径2.5-3.2厘米；
花萼长为花冠的2/3-3/4，裂片线形或线状披针形，长1.1-2厘米，先端渐尖，背面有细而明显的1-3脉；
花冠黄色，背面中央蓝色，裂片椭圆形或卵状椭圆形，长2-2.5厘米，先端钝或钝圆，基部有2个腺窝，腺窝下部囊状，边缘有长4.5-5毫米的柔毛状流苏；
花丝线形，长1-1.2厘米，基部背面有黄色流苏状短毛，花药蓝色，矩圆形，长2.5-3毫米；
子房无柄，狭椭圆状披针形，长7-9毫米，先端渐尖，花柱不明显，柱头小，2裂，裂片近圆形。
花期9月。
