藏獐牙菜，一年生草本，高8-35厘米。
茎直立，深紫色，近圆形，光滑，具条棱，从基部起分枝。
叶无柄，披针形至线状披针形，长1.5-4.5厘米，宽0.35-1.6厘米，愈向茎上部叶愈小，先端急尖，基部耳形，半抱茎，边缘通常密生短睫毛，上面光滑，下面幼时具糙伏毛，老时秃净，叶脉1-3条，细而明显。
聚伞花序顶生及腋生，组成圆锥状复聚伞花序；
花梗深紫色，不整齐，长至10毫米，光滑；
花5数；
花萼筒钟状，长3-3.5毫米，外面密被糙伏毛，裂片三角状披针形，常不整齐，3个大，长于花冠，长7-11毫米，2个小，短于花冠，长5-7毫米，先端急尖或渐尖，边缘具短睫毛，背面光滑，中脉细而明显；
花冠浅蓝色或淡蓝紫色，钟形，一般长10-12毫米，上部外面密被糙伏毛，其余光滑，冠筒长2.5-3毫米，裂片卵状椭圆形，长6-7.5毫米，先端急尖，有短小尖头，边缘密生短睫毛，腺窝5个，着生于冠筒下部中央，与裂片对生，囊状，先端具短流苏；
雄蕊着生于冠筒基部，与裂片互生，整齐，花丝下部白色，上部蓝色，扁平，线状钻形，长4.5-5.5毫米，基部连合成极短的筒，花药蓝色，矩圆形，长1-1.2毫米；
子房无柄，卵状披针形，长4-4.5毫米，先端渐尖，与花柱无明显界限，花柱长1.5-2毫米，柱头小，2裂。
蒴果无柄，卵状椭圆形，长5-6毫米；
种子黄、褐色，矩圆形，长1-1.2毫米，表面近光滑。
花果期8-9月。
