木里蝇子草，多年生草本，高20-50厘米，全株密被短柔毛。
茎疏丛生或单生，直立，不分枝，上部被腺柔毛。
基生叶叶片倒卵状披针形，长5-7厘米，宽13-18毫米，基部渐狭成柄状，顶端急尖，两面均被柔毛，边缘具缘毛，具3基出脉，以中脉较明显，沿脉被柔毛；
上部茎生叶小，叶片卵状披针形，基部近圆形，顶端渐尖。
圆锥花序，小聚伞花序稀疏，对生，常具3花，密被腺柔毛，花梗细，长5-10 (-20)毫米，被腺柔毛；
苞片卵状披针形，草质；
花萼钟形，长约15毫米，直径约6毫米，纵脉紫色，沿脉被腺毛，萼齿三角状卵形，长3-5毫米，顶端圆钝，边缘膜质，具缘毛；
雌雄蕊柄被短毛，长2-3毫米；
花瓣淡紫色，长20-25毫米，爪微露出花萼，狭楔形，基部具缘毛，耳宽，瓣片轮廓近圆形，长4-6毫米，深4裂，中裂片长条形，顶端具2-3个不明显的齿，侧裂片小，近线形，副花冠片近长方形；
雄蕊不外露，花丝无毛；
花柱内藏。
蒴果未见。
花期8月。
