细叶金丝桃，一年生至多年生草本，高5-30厘米，直立或上升，但基部不生根；
主根圆柱状，密生纤维状须根。
茎单一或多数丛生，具4纵线棱，无腺点，不分枝或各式分枝，分枝斜上升。
叶无柄，叶片卵状披针形至线形，长6-13毫米，宽1-3（-）毫米，先端钝形至圆形，基部圆形或心形而抱茎，边缘全缘且背卷，坚纸质，上面绿色，下面淡绿色，散生透明腺点，但边缘无腺点，具1-3基生脉，中脉有1至多条侧脉且直贯叶端，基生侧脉及侧脉均斜上升，脉均在上面凹陷下面凸起。
花序具1-21花，顶生，为单岐或双岐或甚至三岐的聚伞花序，有时有多数具单岐聚伞花序的侧生花枝；
苞片与小苞片与叶同形，但稍短小。
花直径5-8毫米，多少平展；
花蕾卵珠形，先端锐尖；
花梗长2-毫米。
萼片披针形至狭椭圆形，长3-5毫米，宽1.5-2毫米，先端锐尖或近锐尖，全缘，边缘无腺点，全面散生淡色腺点或腺条纹。
花瓣黄色，倒卵形，长5-8毫米，宽2-毫米，先端锐尖，无腺点，宿存。
雄蕊30-40枚，花药黄色，具松脂状腺体。
子房狭圆柱状锥形，长约2毫米，1室；
花柱3，自基部分离，开张，长约1.8毫米。
蒴果卵珠状圆锥形，长约4毫米，宽2.5毫米，无腺斑纹。
种子淡黄褐色，圆柱形，长约0.5毫米，两端锐尖，具纵向棱条，其间有不明显的横条纹，两侧无龙骨状突起，顶端无附属物。
花期6-7月，果期8-9月。
