斑纹木贼，中小型植物。
根茎直立和横走，黑棕色，节和根有黄棕色长毛。
地上枝多年生。
枝一型，高15-20厘米，中部直径1.2-1.5毫米，节间长2.0-4.0厘米，绿色，不分枝。
地上枝有脊6-8条，脊的背部近方形或弧形，中间有浅槽或无，两侧各有1行小瘤；
鞘筒约0.2厘米，绿色但顶部及中部有一圈黑棕色；
鞘齿6-8枚，内弯，三角形，长约0.1厘米，中间黑棕色，边缘黑色，顶端急尖具短芒，膜质，基部的背面有4条纵棱，宿存。
孢子囊穗椭圆状，长0.6-0.8厘米，直径0.2-0.4厘米，顶端有小尖突，无柄。
