异果芥，一年生草本，高15-30厘米。
茎直立，上部分枝，有灰白色细长直立单毛。
基生叶通常羽状浅裂；
茎生叶长椭圆形或长椭圆状线形，边缘呈波状锯齿，上部的叶渐小，叶片狭线形或呈丝状，全缘。
总状花序疏散，花少数；
萼片直立，线形，长4-5毫米，宽1-2毫米；
花瓣红紫色，线形，长8-10毫米，宽约1.5毫米，具长爪；
花丝扁平，薄膜质，两侧稍扩大，花药长圆形，基着；
子房条形，长约5毫米，花柱不明显，柱头稍宽而下延。
长角果有二型：生于枝上部的呈扁条形，长4-5厘米，宽约2毫米；
生于下部的角果不开裂，近圆柱形，带棱角，向上逐渐狭缩，熟时不开裂，有毛。
种子尚未成熟。
花期4-5月，果期5-6月。