山芥碎米荠，多年生草本，高20-70厘米，全体无毛。
根状茎匍匐，有少数匍匐茎，生有多数须根。
茎直立，不分枝，表面有纵棱。
叶为羽状复叶，基生叶有叶柄，小叶2-4对；
着生于茎中部以上的叶无柄，小叶2-5对，顶生小叶近圆形或卵形，长7-25毫米，宽5-13毫米，顶端钝圆，基部宽楔形，全缘或有3-5钝齿，小叶柄长2-10毫米，侧生小叶近圆形或卵形，长5-14毫米，宽4-10毫米，顶端圆，基部圆或宽楔形，全缘或呈浅波状，生于叶柄基部的1对小叶抱茎。
总状花序顶生，花梗长4-7毫米；
萼片卵形，长约3毫米，内轮萼片基部囊状；
花瓣紫色或淡红色，倒卵形，顶端微凹，基部狭窄成楔形；
雌蕊与长雄蕊近于等长，柱头扁球形，比花柱宽。
长角果线形而扁，长2.5-4厘米，宽约1毫米；
果梗长1-2厘米，直立或稍弯、平展或上举。
种子椭圆形或长圆形，长约1.5毫米。
花期5-6月，果期6-7月。
