小叶石豆兰，根状茎匍匐状延伸，粗约0.5毫米，被筒状鞘。
无假鳞茎。
叶在根状茎上疏生，椭圆形或椭圆状圆形，肉质，长5-6毫米，中部宽3-4.5毫米，先端圆钝并且具短突，基部无柄、被膜质鞘，两面无毛，具不明显的脉。
花葶生于叶腋，直立，长约10毫米，总状花序具2朵花；
花序柄纤细，基部被鞘；
花苞片比花梗连同子房短；
花梗和子房长约1毫米；
花浅白色；
萼片膜质，两面无毛，具3条脉；
中萼片长圆形，长2.5毫米，中部宽1毫米，先端钝；
侧萼片斜卵状三角形，长约2.6毫米，基部上方宽1.5毫米，先端急尖；
花瓣比萼片小，狭长圆形，长1-1.3毫米，中部宽约0.3毫米，先端短急尖，具1条脉，边缘全缘；
唇瓣卵状三角形，长约1.5毫米，基部上方宽1毫米，先端圆钝，基部与蕊柱足末端连接而形成关节，边缘全缘，具3条脉；
蕊柱半圆柱形，长约0.7毫米，具长1毫米的蕊柱足；
蕊柱齿很小，三角形。
花期4月。