黑秆蹄盖蕨，根状茎短而斜升，先端和叶柄密被鳞片；
鳞片有阔和窄的两种，阔的为卵状披针形，窄的为纤维状，均为深褐色或有时为栗黑色，有光泽；
叶簇生。
能育叶长 (14-) 40-60厘米；
叶柄短，长 (4-) 5-10厘米，最长达15厘米，直径 (1-) 3-4毫米，连同叶轴均为黑褐色；
叶片倒披针形，长 (10-) 20-50厘米，中部宽 (3-) 5-7厘米，先端钝尖，向下渐变狭，基部宽2-2.5厘米，一回羽状，羽片浅裂至深羽裂；
羽片 ( 12-) 20-30对，下部的对生，向上的互生，密接，略斜展，无柄，下部 (2-) 6-10对羽片逐渐缩短成卵状三角形，长约1厘米，中部的羽片长圆形，长2-3.5厘米，宽1-1.5厘米，先端钝圆并有短尖齿，基部对称，近平截，紧靠叶轴，羽状深裂几达羽轴；
裂片6-8对，平展，密接，卵形，基部一对稍大，长宽各约4-5毫米，有重锯齿，锯齿三角形，尖头，开展，干后常反卷而不易见。
叶脉下面明显，在裂片上为羽状，侧脉3-4对，大都单一，深入锯齿内。
叶干后厚纸质，褐色，光滑，仅沿叶轴密被红褐色或栗黑色披针形和线形的鳞片。
孢子囊群圆形或卵圆形，背生于上侧小脉上（基部上侧二叉小脉上往往各生1枚），每裂片1-5对；
囊群盖小，圆肾形或马蹄形，褐色，膜质，2-4对，位于主脉与叶缘之间；
无囊群盖。
孢子周壁表面有褶皱，并有模糊的颗粒状纹饰。
