小蹄盖蕨，根状茎短小，直立，先端连同叶柄基部疏被浅褐色、披针形鳞片；
叶簇生。
能育叶长约10厘米；
叶柄长2-3厘米，直径约半毫米，禾秆色；
叶片披针形，长4-6厘米，宽1-1.5厘米，先端渐尖，基部几不变狭，一回羽状，羽片羽裂，有柄（长约1毫米），平展或斜展，基部一对略缩短，近卵形或卵状三角形，反折；
中部的羽片斜卵形或斜长圆形，长8-10毫米，宽3.5-4毫米，钝头，有短尖，基部不对称，上侧耳状凸起（耳片分离，卵圆形或长圆形，边缘有三角形尖锯齿），下侧阔楔形，边缘羽裂几达羽轴；
裂片小，2对，倒卵形或长圆形，先端有1-2个尖锯齿。
叶脉下面明显，在裂片上为羽状，侧脉二叉，每锯齿有小脉1条。
叶干后纸质，上面深褐色，下面浅褐色，两面光滑；
叶轴和羽轴下面禾秆色，偶有个别浅褐色、线形小鳞片。
孢子囊弯钩形或马蹄形，生上侧小脉上，每裂片1枚，但耳片上有时2枚；
囊群盖同形，浅褐色，膜质，边缘啮蚀状，宿存。
孢子周壁表面无褶皱。