金沙江蹄盖蕨，根状茎短，直立，先端被红褐色、披针形的鳞片；
叶簇生。
能育叶长达55厘米；
叶柄长达25厘米，基部直径约1.8毫米，黑褐色，密被与根状茎上同样的鳞片，向上禾秆色，光滑；
叶片长圆形，长25-30厘米，中部宽约16厘米，先端渐尖，基部略变狭，近圆形，二回羽状；
羽片约15对，下部的对生，向上的互生，近平展，几无柄，基部一对略缩短，长达7厘米，向基部略变狭，第三对羽片披针形，长达10厘米，宽2-2.4厘米，先端渐尖，基部对称，近截形，一回羽状；
小羽片约14对，基部一对对生，向上的互生，近平展，彼此接近，几无柄，长圆形，长1.2-1.4厘米，宽约7毫米，钝圆头，有撕裂的长尖齿，基部不对称，上侧截形，与羽轴并行，下侧斜楔形，下延在羽轴上成狭翅，彼此相连，两侧深羽裂达1/2；
裂片3-4对，斜长方形，长约2.5毫米，宽约1.5毫米，钝头，并有长尖齿牙。
叶脉两面可见，在裂片上为羽状，侧脉1-2对，斜向上，单一。
叶干后薄草质，淡黄绿色，两面无毛；
叶轴禾秆色，羽轴下面带淡紫红色，略被短毛，叶轴、羽轴和小羽片主脉上面均有贴伏的针状刺。
孢子囊群长圆形，少有弯钩形，每裂片1枚，每小羽片3-4对，靠近主脉；
囊群盖同形，褐色，膜质，全缘，宿存。
孢子周壁表面无褶皱。