云南柴胡，多年生纤细草本，高12-35厘米，直根膨大，略呈纺锤形。
茎单一或数茎，细瘦，上有细条纹。
叶薄，茎下部叶线形，长4-8厘米，宽1.5-4毫米，一般基生叶较短，顶端渐尖，无柄，基部抱茎，5-7脉；
茎中、上部叶狭披针形或披针形，长2.5-10厘米，宽3-7毫米，基部抱茎，下部略扩大，顶端长渐尖，多呈尾状，9-15脉。
复伞形花序除顶生外，侧生的1-2个，直径1.5-2.7厘米；
总苞片2-4，不等大，与茎上部的叶同形，长0.5-3.5厘米，宽2-6毫米；
伞辐2-7，一般3-5，不等长，长3-25毫米；
小总苞片5，等大，草质，长5-9毫米，宽1.6-2.5毫米，长椭圆形，顶端长尾状渐尖，基部楔形，长过花1.5-2倍，5-7脉，偶有长达1.3厘米的；
小伞形花序有花8-14，花瓣紫黑色，很少黄带紫色的，顶端内折，中肋凸出，舌片梯形；
花柱基紫黑色，直径超出子房很多；
花柄长1毫米。
果长圆形，棱狭翼状，每棱槽油管3，合生面4。
花期7-8月，果期8-9月。
