香根芹，多年生草本，高25-70厘米；
主根圆锥形，长2-5厘米，有香气。
茎圆柱形，有分枝，草绿色或稍带紫红色，嫩时有毛，老后光滑。
基生叶片的轮廓呈阔三角形或近圆形，通常2-3回羽状分裂或2回三出式羽状复叶，羽片2-4对，下部第二回羽片卵状长圆形或三角状卵形，长2-7厘米，宽1.5-3.5厘米，边缘有缺刻，羽状浅裂以至羽状深裂，有短柄，末回裂片卵形、长卵形以至卵状披针形，长1-3厘米，宽0.5-2厘米，顶端钝或渐尖，边缘有粗锯齿，缺刻或羽状浅裂，表面深绿，背面淡绿，两面被白色粗硬毛，有时仅在脉上有毛；
叶柄长5-26厘米，基部有膜质叶鞘；
茎生叶的分裂形状如基生叶。
复伞形花序顶生或腋生，花序梗上升而开展，长4-22厘米；
总苞片1-4，钻形至阔线形，长0.5-1.2厘米，膜质，早落；
伞辐3-5，长3-8厘米；
小总苞片4-5，线形，披针形至卵状披针形，长2-5毫米，宽1-1.5毫米，背面或边缘有毛，通常反折；
小伞形花序有孕育花1-6朵，不孕花的花柄丝状，短小；
花瓣倒卵圆形，长约1.2毫米，宽1毫米，顶端有内曲的小舌片；
花丝短于花瓣，花药卵圆形；
花柱基圆锥形，花柱略长于花柱基；
子房被白色而扁平的软毛。
果实线形或棍棒状，长1-2.2厘米，宽2-2.5毫米，基部尾状尖，果棱有刺毛，基部的刺毛较密；
分生果横剖面圆状五角形，胚乳腹面内凹。
花果期5-7月。
