奇形凤仙花，一年生草本，高30-65厘米，全株无毛。
茎肉质，直立或基部斜升，有分枝，干时具条纹，下部节膨大，具多数纤维状根。
叶互生，具柄，在茎上部较密集膜质，椭圆形或卵状椭圆形，长6-12厘米，宽3-5.8厘米，顶端短尖或渐尖，基部楔形，两侧具2-4对具柄腺体，边缘具粗圆齿或圆齿状锯齿，齿端具小尖，侧脉5-6对，弧状弯，上面深绿色，下面浅绿色。
花单生于上部叶腋；
花梗细，长1-1.5厘米，果期略伸长，中上部具2苞片，下方的线形，长1.5-2.5毫米，上方的卵形，长4-5.5毫米，渐尖，宿存。
花黄色，长2.5-3厘米；
侧生萼片2，斜卵形或近圆形，长8-10毫米，宽8-9毫米，不等侧，顶端急尖，背面有紫色斑，中脉增厚，具宽龙骨状突起，边缘一侧近全缘，另一侧具4 (5) 尖齿；
旗瓣近圆形，长10-12毫米，宽13-14毫米，顶端圆形，基部宽楔形，背面中肋增厚，中部以上具鸡冠状突起，顶端喙尖。
翼瓣具柄，长2.8-3厘米，2裂，基部裂片小，长圆形，长4.5-6毫米，宽约4毫米，顶端圆形，具伸长达6-7毫米的细丝，上部裂片斧形，长22-25毫米，宽11-13毫米，顶端尖，但无细丝。
背部具宽小耳；
唇瓣囊状，长3厘米，口部斜上，长18-20毫米，先端渐尖，基部圆形或近截形，急狭成2-3距，每个距又2分裂，状似4-6距。
距稍内弯，长3.5-5毫米。
花丝线形；
花药卵圆形，顶端钝；
子房纺锤状，长4-5毫米，顶端喙尖。
蒴果线状圆柱形，长3-4厘米，喙尖。
种子多数，长圆状球形，长约2毫米，褐色，具疣状突起。
花果期8-10月。
