秦岭凤仙花，一年生草本，高30-60厘米，全株无毛。
茎细，直立，上部有分枝，下部无叶，具短匍匐根。
叶互生，具柄，最上部叶密集，近轮生；
叶片膜质，卵形或卵状椭圆形，长6-9厘米，宽2.5-4.5厘米，顶端短渐尖，基部楔形，边缘具密圆齿状锯齿，齿端具小尖，侧脉5-6对，上面绿色，下面浅绿色；
叶柄长约3厘米，最上部的叶柄短或近无柄。
总花梗生于上部叶腋，短于叶，长4-6厘米，具1花；
花梗细，长4厘米，中上部具苞片；
苞片革质，卵状披针形，渐尖，长4-5毫米，宿存。
花粉红色，干时紫色，长2.5-3厘米。
侧生萼片2，披针形，长5-6毫米，宽2.5-3毫米，膜质，顶端具小尖，中肋背面增厚，绿色，具龙骨状突起，基部扩大且具齿；
旗瓣心形，深僧帽状，背面中肋增厚，具宽龙骨状突起，龙骨突绿色；
翼瓣无柄，长约7-20毫米，2裂，基部裂片卵形，上部裂长于基裂片的二倍，宽或近斜卵圆形，背部具圆小耳；
唇瓣漏斗形，长2-2.5厘米，口部极斜，长7-8毫米，先端细尖，檐部舟状，基部狭成长10-15毫米丝状稍弯的细距。
花丝线形；
花药顶端突尖。
子房纺锤形，长约3毫米，顶端喙尖。
蒴果线形，长2.5-3厘米。
种子少数 (约10枚) ，长圆形，长3-4毫米，褐色，光滑。
花期8月，果期9-10月。
