蕨叶小芹，植株细柔，高15-30厘米。
根胡萝卜状，长2-7厘米，径0.5-1厘米。
茎单生或2-3个，不分枝或1-3个分枝，微被柔毛。
基生叶2-4，有柄，柄基部有膨大的叶鞘，呈卵圆形或长卵形，叶柄包括鞘长2-5厘米，有白色柔毛；
叶片轮廓呈三角形，长3-5厘米，宽2-4厘米，2回羽状分裂，第1回羽片3-4对，下面的一对有短柄，其余无柄，末回裂片长卵形，边缘有齿，叶轴及裂片背面有白色柔毛；
茎中下部的叶片与基生叶同形，向上渐小，1回羽状分裂。
复伞形花序有总苞片1-4，线状披针形；
小伞形花序有花10-15, 白色；
萼齿细小；
花瓣卵形至阔倒卵形，基部有爪，顶端钝圆或微凹；
花柱基圆锥形，花柱与花柱基近等长，向两侧弯曲。
果实卵形至长卵形；
胚乳腹面平直。
花果期6-9月。