并头黄芩，根茎斜行或近直伸，节上生须根。
茎直立，高12-36厘米，四棱形，基部粗1-2毫米，常带紫色，在棱上疏被上曲的微柔毛，或几无毛，不分枝，或具或多或少或长或短的分枝。
叶具很短的柄或近无柄，柄长1-3毫米，腹凹背凸，被小柔毛；
叶片三角状狭卵形，三角状卵形，或披针形，长1.5-3.8厘米，宽0.4-1.4厘米，先端大多钝，稀微尖，基部浅心形，近截形，边缘大多具浅锐牙齿，稀生少数不明显的波状齿，极少近全缘，上面绿色，无毛，下面较淡，沿中脉及侧脉疏被小柔毛，有时几无毛，具多数凹点，有时有不具凹点，侧脉约3对，上面凹陷，下面明显凸起。
花单生于茎上部的叶腋内，偏向一侧；
花梗长2-4毫米，被短柔毛，近基部有一对长约1毫米的针状小苞片。
花萼开花时长3-4毫米，被短柔毛及缘毛，盾片高约1毫米，果时花萼长4.5毫米，盾片高2毫米。
花冠蓝紫色，长2-2.2厘米，外面被短柔毛，内面无毛；
冠筒基部浅囊状膝曲，宽约2毫米，向上渐宽，至喉部宽达6.5毫米；
冠檐2唇形，上唇盔状，内凹，先端微缺，下唇中裂片圆状卵圆形，先端微缺，最宽处7毫米，2侧裂片卵圆形，先端微缺，宽2.5毫米。
雄蕊4，均内藏，前对较长，具能育半药，退化半药明显，后对较短，具全药，药室裂口具髯毛；
花丝扁平，前对内侧后对两侧下部被疏柔毛。
花柱细长，先端锐尖，微裂。
花盘前方隆起，后方延伸成短子房柄。
子房4裂，裂片等大。
小坚果黑色，椭圆形，长1.5毫米，径1毫米，具瘤状突起，腹面近基部具果脐。
花期6-8月，果期8-9月。
