紫斑百合，鳞茎近球形，高约2.5厘米，直径约2厘米，鳞片披针形或卵状披针形，长2-2.5厘米，宽1-1.2厘米。
茎高40-120厘米，有小乳头状突起。
叶散生，披针形或矩圆状披针形，长5-10厘米，宽2-3厘米，先端渐尖，基部渐狭，边缘有小乳头状突起，具5条脉，两面无毛。
花单生或3-5朵排列成总状花序；
苞片矩圆状披针形，长5.5-10厘米；
花梗长9-13厘米；
花淡黄色或绿黄色，喉部带紫色，花稍呈喇叭形，花被片反卷，长6-9厘米，宽1.6-1.8厘米，蜜腺两边无乳头状突起；
花丝长5-5.5厘米，无毛，花药长8-9毫米；
子房圆柱形，长1.5-l.8厘米，花柱长4-5厘米，柱头膨大，径约4毫米。
花期6-7月。
