绿花玉凤花，植株高13-20厘米。
块茎肉质，长圆形，长1.5-2厘米，直径0.8-1厘米。
茎纤细，坚挺直立，无毛，基部4-5枚叶。
叶片线形，长5-10厘米，宽4-6毫米，先端渐尖或急尖，基部抱茎，无毛。
总状花序具几朵至10余朵花，长2-4厘米，无毛，基部具4-5枚苞片状鞘；
鞘披针形、先端长渐尖；
花苞片卵状披针形，长4毫米，先端长渐尖，较子房短多；
子房圆柱形，细长，上部弧曲，扭转，无毛，连花梗长约1厘米；
花小，黄绿色，无毛；
中萼片卵圆形，凹陷，长2毫米，宽1.3毫米，先端钝，具3脉，与花瓣靠合呈兜状；
侧萼片反折，斜卵状长圆形，长2.8毫米，宽1.3毫米，先端钝，具3脉；
花瓣直立，斜卵形，长2毫米，宽1.1毫米，先端急尖，具1脉；
唇瓣肉质，长3.2毫米，近基部3深裂，裂片线形，先端钝，侧裂片与中裂片近呈直角叉开，裂片长度常有变化，侧裂片通常长2毫米，中裂片长约3毫米；
距细长，细圆筒状，下垂，长可达1.6厘米，较子房长很多，末端不增粗；
蕊柱短，直立；
花药顶部略凹陷；
药室叉开，下部延伸成短的沟并且向上弯；
花粉团倒卵球形，具较短的柄和粘盘；
蕊喙短而宽；
柱头2个，隆起，棒状；
退化雄蕊2个，线形。
花期6月。