绿花矮泽芹，矮小，光滑草本，高3.5-32厘米。
主根有细长的根茎，根茎上有膨大的小结节。
茎单生，直立，有分枝，有纵沟纹，基部常残留纤维状的叶鞘。
基生叶或茎下部的叶柄长1.5-6厘米，下部边缘有阔膜质的叶鞘；
叶片轮廓呈长圆形，长1.5-3.5厘米，宽0.8-2.5厘米，1回羽状分裂，羽片膜质，2-4对，每对彼此疏离，侧生的羽片卵形，阔倒卵形或卵状长圆形，长4-12毫米，宽2-6毫米，顶端通常3浅裂，很少无裂，顶生的羽片阔倒卵形以至扇形，3-5裂，所有的羽片表面绿色，背面淡绿色。
较上部的茎生叶常有阔膜质的叶柄，羽片卵状披针形以至阔线形，全缘。
复伞形花序顶生或腋生，花序梗细弱，长1.5-8厘米；
总苞片2-5，全缘或有分裂；
顶生的伞形花序有伞辐6-11，开展，纤细，不等长；
小总苞片无或偶有1-2，短于花柄；
小伞形花序有花7-15，花柄近等长，长3-6毫米，排列疏松；
萼齿极小；
花瓣草绿色，倒卵形，长1-1.2毫米，宽约1毫米，基部较窄，顶端钝；
花丝短于花瓣；
花药近圆形，长约0.4毫米；
花柱基扁压，扩展，花柱幼时直立，果时向外反折。
果实卵形或长卵形，长约1.5毫米，宽与长几相等，基部略呈心形，两侧微扁，胚乳腹面微凹，每槽有油管1，合生面2。
花果期7-8月。
