蒙自草胡椒，矮小、丛生草本，高10-15厘米或稍过之；
茎分枝，基部匍匐，节上生根，无毛。
叶对生或3-4片轮生，膜质，有腺点，中、下部的通常小，倒卵状长圆形或倒卵状楔形，稀近圆形，长6-15毫米，宽5-8毫米，顶端圆或微凹，基部楔形，两面均无毛，但顶端尤其是凹缺处有细缘毛；
顶端的叶大，倒卵形或近椭圆形，长18-28毫米，宽12-20毫米；
叶脉3条，基出；
叶柄长4-8毫米，通常无毛。
穗状花序顶生，稀腋生，通常单生，少有簇生，长2-4.5厘米，直径约2毫米；
总花梗长1-1.5厘米，其与花序轴均无毛；
苞片圆形，具短柄，盾状，直径约0.5毫米；
花药近圆形，与花丝近等长; 子房卵形，偏斜，很小，具乳头状疏柔毛。
浆果卵形，顶端稍尖，直径约0.4毫米，表面粗糙。
花期7-10月。
